Sistema de archivos NTFS: qué es y qué errores puede dar en Windows

Cuando Windows avisa de que "la estructura del sistema de archivos NTFS está dañada", de que un USB no deja copiar archivos grandes, o de que una carpeta niega el acceso aunque seas el dueño, el problema suele estar en NTFS, el sistema de archivos que usa Windows desde XP. Aquí vas a ver qué es NTFS, cómo confirmar el fallo en tu PC y cómo arreglarlo con las herramientas que ya trae Windows, sin tocar el Registro ni instalar nada. Lo que sigue aplica a Windows 10 (sin soporte de seguridad desde el 14/10/2025, salvo ESU) y Windows 11.

Qué es NTFS y por qué lo usa Windows

NTFS (New Technology File System) es el sistema de archivos de Windows desde 1993 (NT 3.1) y el predeterminado en todas las versiones de consumo desde XP. Su unidad básica es el clúster, normalmente de 4 KB, y todo lo que hay en el volumen se organiza en una tabla maestra llamada MFT ($MFT), que Windows guarda a un tercio del disco y de la que mantiene una copia ($MFTMirr) por si la principal se rompe.

Frente a FAT32 y FAT, NTFS ofrece permisos por archivo y carpeta (ACL), cifrado con EFS, cuotas de disco, compresión transparente con LZNT1, rutas largas de hasta 32 767 caracteres y, sobre todo, tamaños de archivo y de volumen enormes: desde Windows 10 1709 y Windows Server 2019, un volumen NTFS puede llegar a 8 PB y un solo archivo no tiene límite práctico. En sistemas no Windows (Linux, por ejemplo) NTFS se lee sin más; para escribir hacen falta drivers extra. Su inconveniente real no es NTFS en sí, sino cómo reacciona cuando el disco falla, se va la luz o se cambian permisos sin querer.

Por qué falla NTFS en tu disco: lo que se ve y su causa probable

Confirma el fallo de NTFS antes de tocar nada

Antes de ejecutar chkdsk, cambiar permisos o formatear, hay que distinguir qué causa es la tuya. Windows deja pistas en cuatro sitios: el Visor de eventos, Administración de discos, Explorador de archivos y el propio disco. Cada uno confirma una causa distinta.

El Visor de eventos: el identificador 55 y el 98

Pulsa Win+R, escribe eventvwr.msc y abre el Visor de eventos. Ve a Registros de Windows > Sistema y filtra por el origen "Ntfs"; quédate con los eventos 55 (estructura dañada, reparar con chkdsk C: /f) y 98 (volumen reparado o que necesita chkdsk /scan). Si hay un 55 reciente, el problema es la estructura NTFS; si solo hay 98, ya se intentó reparar y conviene repetir el análisis.

La unidad en Administración de discos y en Explorador

Abre Administración de discos (Win+R, diskmgmt.msc) y mira la columna Estado de cada volumen: "Correcto" es lo normal, "RAW" significa que el sistema de archivos se ha perdido y hay que reparar con chkdsk antes de hacer nada. En el Explorador, si solo una carpeta falla y el resto del disco está bien, casi siempre es un problema de permisos, no de NTFS; para confirmarlo, clic derecho sobre la unidad > Propiedades > Herramientas > Comprobación de errores y mira si Windows propone un análisis.

Los permisos y el dueño de la carpeta: icacls y effective access

Para saber si el fallo es de permisos, clic derecho sobre la carpeta > Propiedades > Seguridad > Opciones avanzadas > Acceso efectivo y comprueba si tu usuario aparece con todo permitido. Si Acceso efectivo muestra "Denegar" pero la pestaña Seguridad dice que tienes permiso, el problema real es el dueño. Para verlo sin hacer clic, en CMD como administrador:

icacls "C:\ruta\a\la\carpeta"

Si la salida muestra BUILTIN\Administradores:(I)(F) con (I) (permiso heredado pero sin aplicar) en vez de (F) pleno, el dueño está mal y toca reasignarlo; ves Acceso denegado (Error 5) al intentar leer, NTFS no está roto.

El estado físico del disco con CHKDSK solo lectura

Si sospechas que el disco tiene un problema físico (ruidos, cortes de luz, errores que vuelven), primero analiza sin reparar. En Terminal como administrador:

chkdsk C: /scan /v

Si la salida incluye líneas tipo "Bad Sector" o "Sector defectuoso", el fallo es del disco físico: chkdsk /f no basta y toca cambiarlo. Para confirmar el estado SMART:

wmic diskdrive get status

Si dice "Predic Fail" o "Error", haz copia de todo lo importante antes de seguir.

"La estructura del sistema de archivos NTFS está dañada": repara el volumen

Esta parte cubre las dos primeras causas de la tabla: estructura NTFS dañada (evento 55) y sectores defectuosos. El arreglo es el mismo: chkdsk /f. Si el disco tiene sectores defectuosos físicos, chkdsk los marca y los aísla, pero el problema de fondo es el disco.

chkdsk C: /f desde Símbolo del sistema como administrador

chkdsk revisa el árbol NTFS, repara la tabla maestra (MFT) y marca los clústeres defectuosos. En Windows 11, clic derecho en Inicio (Win+X) > Terminal (Administrador); en Windows 10, Windows PowerShell (Administrador). Escribe:

chkdsk C: /f

Si la unidad es la del sistema, te preguntará si quieres ejecutarlo al reiniciar; pulsa S y reinicia. Al arrancar, chkdsk corre antes de Windows y al volver verás uno de estos mensajes:

Comprobación de errores desde Propiedades

Si prefieres no usar la consola, la herramienta gráfica hace lo mismo. Clic derecho sobre la unidad (por ejemplo C:) > Propiedades > Herramientas > Comprobación de errores > Examinar en Windows 10 o Buscar y reparar en Windows 11. Windows programará la comprobación para el próximo reinicio si la unidad es la del sistema. Útil cuando el lector desconfía del CMD.

NTFS deja archivos de más de 4 GB: convierte o reformatea la unidad

Aquí estás cuando tu USB o disco secundario está en FAT32 (y no acepta un .ISO, una película 4K o un .vhdx) o se ha vuelto RAW tras una extracción mal hecha. La salida es la misma: pasarlo a NTFS o a exFAT. Si solo quieres copiar archivos grandes y la unidad está en FAT32 o RAW, convierte primero; si está en exFAT, no hay conversión directa y hay que formatear.

Convertir la unidad a NTFS sin formatear

convert cambia FAT32 o RAW a NTFS conservando los datos. En Terminal como administrador:

convert E: /fs:ntfs

Sustituye E: por la letra real de la unidad (la ves en Explorador o en Administración de discos). Tarda según el tamaño; al terminar dice "Conversión completada" y ya puedes copiar archivos de cualquier tamaño. Desde exFAT no se puede convertir directamente: toca copiar lo importante a otro disco, formatear y volver a copiar.

Formatear a exFAT o NTFS desde Administración de discos

Si la unidad se ha quedado en RAW (Windows no la reconoce) o quieres empezar de cero, formatea. Abre Administración de discos (Win+R, diskmgmt.msc), clic derecho sobre la partición > Formatear. Elige NTFS si la usarás solo en Windows, o exFAT si la vas a mover a Mac, Linux o consolas; ambos admiten archivos de más de 4 GB.

Acceso denegado en una carpeta NTFS: cambia el dueño y los permisos

Este caso es para cuando Windows no te deja abrir una carpeta tuya o la carpeta sale en verde (cifrada con EFS) tras un cambio de usuario o una reinstalación. NTFS no está roto: lo que se rompió fueron los permisos o el certificado de cifrado. Tocar permisos del sistema (carpetas dentro de C:\Windows) puede dejar Windows sin arrancar, así que limítate a tus carpetas de usuario.

Hazte dueño de la carpeta

El dueño es el que puede cambiar los permisos de la carpeta; si lo perdió una restauración, un cambio de usuario o un script, hay que recuperarlo. Clic derecho sobre la carpeta > Propiedades > Seguridad > Opciones avanzadas > junto a "Propietario" pulsa Cambiar > escribe tu usuario (o "Todos") y marca "Reemplazar propietario en subcontenedores y objetos". Acepta dos veces y vuelve a abrir la carpeta: ya deberías entrar.

Quita el cifrado EFS con el certificado anterior

Si la carpeta sale en verde (nombre en color en el Explorador) y no se abre después de cambiar de usuario o reinstalar Windows, es EFS: los archivos están cifrados con un certificado que solo tenía el usuario anterior. Si aún existe el perfil viejo, la clave está en C:\Usuarios\<anterior>\AppData\Roaming\Microsoft\Crypto\RSA\; cópiala al nuevo usuario y reimporta el .pfx con doble clic > "Instalar PFX" > "Usuario actual" > siguiente > escribir la contraseña.

Si NTFS sigue fallando: copia, repara el sistema y reinstala

Cuando chkdsk ya no arregla el evento 55, los permisos no cambian el "Acceso denegado" o el disco hace ruidos y repite errores, el problema ya no es NTFS sino Windows o el propio disco. Antes de reinstalar, repara los archivos de Windows con DISM y SFC; después, si sigue, reinstala conservando archivos.

DISM y SFC por si el sistema de archivos está bien pero Windows no

DISM repara la imagen de Windows desde la que SFC repone archivos dañados. En Terminal como administrador, primero:

DISM /Online /Cleanup-Image /RestoreHealth

Cuando termine ("La operación de restauración se completó correctamente"), ejecuta:

sfc /scannow

Si SFC dice "Protección de recursos de Windows encontró archivos dañados y los reparó correctamente", reinicia. Si dice "encontró archivos dañados pero no pudo reparar algunos", el detalle está en C:\Windows\Logs\CBS\CBS.log; suele tocar reinstalar. SFC no repara controladores ni programas de terceros; para esos, reinstala desde la web oficial del fabricante.

Copia de seguridad completa y reinstalación conservando archivos

Antes de tocar nada drástico, copia lo importante. Configuración > Cuentas > Windows Backup (en Windows 11) o un disco externo con copiar y pegar (vale en ambas versiones). Después, en Windows 11 ve a Configuración > Sistema > Recuperación > Restablecer el PC > Conservar mis archivos; en Windows 10, Configuración > Actualización y seguridad > Recuperación > Restablecer este PC > Conservar mis archivos. La opción Home no tiene todas las opciones de recuperación de Pro (por ejemplo, restablecer desde la nube o instalación limpia remota).

Lo que ya has descartado del sistema de archivos NTFS

• NTFS, en sí, no se rompe por usarlo; los fallos vienen del disco, de la corriente o de permisos y cifrado.
• Repasar siempre primero el Visor de eventos (IDs 55 y 98), después chkdsk, después dueño y permisos, y solo al final reinstalar.
• Si chkdsk repite errores y el estado SMART ya no es "OK", cambiar el disco antes que reinstalar Windows.
• Para archivos de más de 4 GB en un USB: convertir a NTFS (convert E: /fs:ntfs) o formatear a exFAT si también va a Mac o consola.
• EFS sin certificado del usuario anterior no se recupera: haz copia antes de reinstalar Windows.

Datos comprobados en octubre de 2026.

Dudas sobre el sistema de archivos NTFS en Windows